上海海關(guān)學(xué)院前身為創(chuàng)建于1953年的上海海關(guān)學(xué)校;1980年5月,經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn),升格為上海海關(guān)?茖W(xué)校;1996年4月,原國家教委批準(zhǔn)學(xué)院更名為上海海關(guān)高等專科學(xué)校;2007年3月,經(jīng)教育部批準(zhǔn),設(shè)立上海海關(guān)學(xué)院。2018年5月,學(xué)校獲批成為碩士學(xué)位授予單位。
截至2020年12月,學(xué)校校園占地面積521畝,下設(shè)蘇州分校,占地133畝,占地面積312250平方米,教學(xué)科研儀器設(shè)備總值8853.60萬元;設(shè)有8個教學(xué)院(系、部),設(shè)置10個本科專業(yè),2個碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點;學(xué)校教師總數(shù)147人,其中教授19人,在校生總規(guī)模為2710人。